اولا : من حيث الهدف
الهدف الرئيسي للمراجع الخارجى هوخدمة طرف ثالث وهم اصحاب المؤسسة
فى ابداء الرائ فى سلامة و عدالة القوائم المالية و الهدف الثانوى هو اكتشاف الاخطاء و الغش
اما الهدف الرئسى للمراجع الداخلى خدمة الادارة من التاكد من ان النظام المحاسبى كفؤ و يقدم بيانات سليمة و صحيحة للادارة و من ضمن اهدافة الاساسية اكتشاف الاخطاء و الغش و الانحرافات داخل المؤسسة
ثانيا نوعية من يقوم بالمراجعة
يقوم بالمراجعة الخارجية شخص مستقل من خارج المؤسسة و يعين من قبل الملاك
اما من يقوم بالمراجعة الداخلية شخص من داخل المؤسسة او من داخل الهيكل التنظيمى للمؤسسة
ثالثا درجة الاستقلالية فى اداء العمل و ابداء الرأى
يتمتع المراجع الخارجى بالاستقلال التام عن الادارة فى عملية الفحص و ابداء الراى
اما المراجع الداخلى فيتمتع باستقلال جزئ عن الادارة و لكن يخدم الادارات الاخرى